ご報告ありがとうございます!
ここ、次のアップデートで修正入れます。お急ぎの場合は下記の変更を適用してみてください。
themes/unitone/App/Controller/Manager/Manager.php
の
if ( ! empty( array_diff_assoc( static::$default_settings, static::get_settings() ) ) ) {
を
if ( ! empty( array_udiff( static::$default_settings, static::get_settings(), fn( $a, $b ) => $a <=> $b ) ) ) {
に変更